Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ArxO35085 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ArxO35085 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ArxO35085 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ArxO35085 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ArxO35085 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ArxO35085 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ArxO35085 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ArxO35085 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ArxO35085 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ArxO35085 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ArxO35085 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ArxO35085 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ArxO35085 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ArxO35085 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ArxO35085 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ArxO35085 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ArxO35085 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ArxO35085 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ArxO35085 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ArxO35085 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ArxO35085 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ArxO35085 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ArxO35085 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ArxO35085 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ArxO35085 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ArxO35085 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ArxO35085 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ArxO35085 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ArxO35085 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ArxO35085 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ArxO35085 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ArxO35085 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ArxO35085 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ArxO35085 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ArxO35085 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ArxO35085 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ArxO35085 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ArxO35085 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ArxO35085 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ArxO35085 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ArxO35085 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ArxO35085 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ArxO35085 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ArxO35085 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ArxO35085 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ArxO35085 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ArxO35085 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ArxO35085 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ArxO35085 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ArxO35085 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ArxO35085 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ArxO35085 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ArxO35085 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ArxO35085 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ArxO35085 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ArxO35085 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ArxO35085 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ArxO35085 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ArxO35085 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ArxO35085 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ArxO35085 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ArxO35085 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ArxO35085 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ArxO35085 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ArxO35085 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ArxO35085 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ArxO35085 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ArxO35085 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ArxO35085 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ArxO35085 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ArxO35085 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ArxO35085 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ArxO35085 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ArxO35085 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ArxO35085 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ArxO35085 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms