Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn4O35054 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn4O35054 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn4O35054 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn4O35054 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn4O35054 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn4O35054 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn4O35054 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn4O35054 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn4O35054 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn4O35054 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn4O35054 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn4O35054 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn4O35054 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn4O35054 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn4O35054 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn4O35054 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn4O35054 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn4O35054 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn4O35054 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn4O35054 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn4O35054 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn4O35054 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn4O35054 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn4O35054 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn4O35054 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn4O35054 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn4O35054 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn4O35054 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn4O35054 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms