Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms