Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MttpO08601 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MttpO08601 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MttpO08601 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MttpO08601 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MttpO08601 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MttpO08601 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MttpO08601 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MttpO08601 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MttpO08601 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MttpO08601 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MttpO08601 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MttpO08601 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MttpO08601 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MttpO08601 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MttpO08601 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MttpO08601 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MttpO08601 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MttpO08601 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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MttpO08601 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MttpO08601 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MttpO08601 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MttpO08601 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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MttpO08601 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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MttpO08601 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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MttpO08601 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MttpO08601 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MttpO08601 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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