Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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