Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

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Length 857 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vmn2r88L7N1W8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vmn2r88L7N1W8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vmn2r88L7N1W8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vmn2r88L7N1W8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vmn2r88L7N1W8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Vmn2r88L7N1W8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Vmn2r88L7N1W8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Vmn2r88L7N1W8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r88L7N1W8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r88L7N1W8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r88L7N1W8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r88L7N1W8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r88L7N1W8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r88L7N1W8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r88L7N1W8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r88L7N1W8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r88L7N1W8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r88L7N1W8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r88L7N1W8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r88L7N1W8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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