Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms