Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BC024978J3QPC3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms