Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Gm19965J3QNY8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Gm19965J3QNY8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Gm19965J3QNY8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Gm19965J3QNY8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Gm19965J3QNY8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Gm19965J3QNY8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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