Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20918J3QN17 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms