Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top6blJ3QMY9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Top6blJ3QMY9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms