Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms