Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK1

Sgo2b, Shugoshin 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2bJ3QMK1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgo2bJ3QMK1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sgo2bJ3QMK1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sgo2bJ3QMK1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgo2bJ3QMK1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgo2bJ3QMK1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgo2bJ3QMK1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgo2bJ3QMK1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgo2bJ3QMK1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgo2bJ3QMK1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Sgo2bJ3QMK1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sgo2bJ3QMK1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sgo2bJ3QMK1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sgo2bJ3QMK1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sgo2bJ3QMK1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sgo2bJ3QMK1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sgo2bJ3QMK1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sgo2bJ3QMK1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sgo2bJ3QMK1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sgo2bJ3QMK1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sgo2bJ3QMK1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgo2bJ3QMK1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sgo2bJ3QMK1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sgo2bJ3QMK1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sgo2bJ3QMK1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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