Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm21818J3KMS6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm21818J3KMS6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm21818J3KMS6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm21818J3KMS6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm21818J3KMS6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm21818J3KMS6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21818J3KMS6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm21818J3KMS6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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