Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms