Protein–RNA interactions for Protein: H3BK29

Vmn2r6, Vomeronasal 2, receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r6H3BK29 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r6H3BK29 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r6H3BK29 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r6H3BK29 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r6H3BK29 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r6H3BK29 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r6H3BK29 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r6H3BK29 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r6H3BK29 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r6H3BK29 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r6H3BK29 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r6H3BK29 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r6H3BK29 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn2r6H3BK29 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn2r6H3BK29 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms