Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc4lG5E8X2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms