Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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