Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms