Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h12bG3X9I7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h12bG3X9I7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h12bG3X9I7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h12bG3X9I7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h12bG3X9I7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc3h12bG3X9I7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc3h12bG3X9I7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms