Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Farp1F8VPU2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms