Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdh9F8VPK8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms