Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms