Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3443F7CCV5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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