Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rarres1F6ZIS7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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