Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm5218F6YH22 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm5218F6YH22 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms