Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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