Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

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Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Herc6F2Z461 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Herc6F2Z461 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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