Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd7E9Q9W7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms