Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms