Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap11-1E9Q2E9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap11-1E9Q2E9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap11-1E9Q2E9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap11-1E9Q2E9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms