Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdzd2E9Q1M1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms