Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B3

Uncharacterized membrane protein C3orf80 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9Q0B3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E9Q0B3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E9Q0B3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E9Q0B3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9Q0B3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9Q0B3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9Q0B3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E9Q0B3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9Q0B3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9Q0B3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
E9Q0B3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9Q0B3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9Q0B3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9Q0B3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9Q0B3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E9Q0B3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9Q0B3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E9Q0B3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E9Q0B3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E9Q0B3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E9Q0B3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E9Q0B3 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E9Q0B3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9Q0B3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9Q0B3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E9Q0B3 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E9Q0B3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms