Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3095E9Q058 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3095E9Q058 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms