Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20425E9Q035 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms