Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Clca3bE9PUL3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3bE9PUL3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms