Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cngb1E1AZ71 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cngb1E1AZ71 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms