Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh8D3Z6W3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh8D3Z6W3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh8D3Z6W3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh8D3Z6W3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh8D3Z6W3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh8D3Z6W3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh8D3Z6W3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh8D3Z6W3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh8D3Z6W3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh8D3Z6W3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh8D3Z6W3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh8D3Z6W3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh8D3Z6W3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh8D3Z6W3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh8D3Z6W3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh8D3Z6W3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh8D3Z6W3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh8D3Z6W3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh8D3Z6W3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rdh8D3Z6W3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rdh8D3Z6W3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rdh8D3Z6W3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh8D3Z6W3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms