Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc8D3YZV8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms