Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6685D3YYP3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6685D3YYP3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms