Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cttnbp2B9EJA2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms