Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mterf1bB9EJ57 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms