Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Phf11bB4XVQ1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Phf11bB4XVQ1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Phf11bB4XVQ1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Phf11bB4XVQ1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf11bB4XVQ1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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