Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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Rd3lB2RV38 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rd3lB2RV38 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rd3lB2RV38 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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