Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprbB2RU80 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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