Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ssxb8B1AY40 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Ssxb8B1AY40 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ssxb8B1AY40 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb8B1AY40 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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