Protein–RNA interactions for Protein: B1AX85

6030498E09Rik, RIKEN cDNA 6030498E09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030498E09RikB1AX85 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
6030498E09RikB1AX85 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
6030498E09RikB1AX85 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms