Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms