Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm436B1AVU6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm436B1AVU6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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