Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Grik3B1AS29 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik3B1AS29 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms